巧克力囊肿是不太好医治的，主要是巧克力囊肿的复发较高，并且巧克力囊肿是较为大的肿块，会影响到女士的生育功能及其卵巢的功能，因此有生孕规定的女士，出現巧克力囊肿，一般是挑选雌激素的方法治疗，能够 抑止紊乱子宫内膜出現委缩，可是更年期的女士出現巧克力囊肿最好挑选子宫全切术，能够 具有除根的实际效果。
1.医治标准
朱古力囊肿的治疗标准是：对有生孕规定的年青女性一般选用用药治疗并定期随诊查验。若病症较重，经用药治疗实际效果不显著，或子宫卵巢有很大肿块的，能够 选用传统性手术治疗，如子宫卵巢子宫内膜襄肿朱古力液吸脂术，子宫内膜襄肿剥除术或患肢子宫卵巢摘除术，以保存一切正常子宫卵巢和生孕作用。但是，经传统性术后仍有可能发作。病人应坚持不懈随诊并争得尽快怀孕，对40岁以上，年纪很大且无生孕规定的女性，能够 摘除全孑宫及其一侧或两侧子宫卵巢和双侧输卵管。
2.用药治疗
也就是保守治疗，一般是选用雌激素开展医治，基本原理便是根据抑止雌性激素生成，促使紊乱的子宫内膜出現委缩。假如症状并不大得话，此方式 還是能够 试一试。可是如果是紊乱的症状很大的襄肿，在选用用药治疗，基本上没什么实际效果了，只有选用手术医治。
3.手术医治
视病况等详细情况选用中西结合、卵巢囊肿脱离术等多种多样治疗方案合理医治。手术治疗是微创手术术，张口小，修复起來快。
4.部分医治
关键用以经痛，不孕症，骨盆包块与肿块
5.电灼医治
关键用以手术治疗摘除一部分孑宫内膜异位灶。
6.除根手术治疗
作全孑宫及两侧附件摘除，并尽可能消除疾病。子宫卵巢巧克力囊肿用手术医治是当今切实可行的方式 ，能够 提升怀孕机遇。
7.中西医医治
适用变病普遍，黏连密不可分，手术治疗不容易完全摘除者。
